Modified peptidoglycan substrates for screening and discovery of peptidoglycan de-N-acetylases involved in bacterial pathogenesis

Autor/a

Sánchez Conde, Cristina

Abstract

En la búsqueda de nuevas dianas terapéuticas para combatir las infecciones bacterianas, es necesario entender sus patrones y mecanismos infecciosos. Las bacterias patógenas modifican la estructura de su red de peptidoglicanos para evitar su reconocimiento por las enzimas y receptores huéspedes implicados en la inmunidad innata. Una de las modificaciones más frecuente es la deacetilación de N-acetilglucosamina (GlcNAc) y/o ácido N-acetilmurámico (MurNAc) del esqueleto del peptidoglicano.
Las deacetilasas de peptidoglicano se clasifican según su especificidad de sustrato, pero actualmente, no hay ninguna firma de secuencia que distinga a cada grupo: las GlcNAc deacetilasas, las deacetilasas canónicas de MurNAc y las MurNAc deacetilasas similares a la BsPdaC (recientemente propuestas bioquímica del IQS). Pocas de las enzimas clasificadas, sin embargo, se han caracterizado bioquímicamente, por lo que, para comprender bien su estructura y función, es necesario estudiar otras posibles deacetilasas con un ensayo basado en motivos de peptidoglicano definidos.
Para obtener los fragmentos de peptidoglicano como sustratos específicos de cada grupo de deacetilasas, el peptidoglicano ha sido modificado por dos autolicinas, expresadas de forma recombinante y purificadas: CwlH y CwlE. Aunque la actividad de las autolicinas no se ha podido determinar directamente, sus productos han sido validados mediante un ensayo funcional con deacetilasas específicas.

 

Director/a

Planas Sauter, Antoni  

Estudios

IQS SE - Máster en Bioingeniería

Fecha

2020-07-29