Evaluación funcional de un gen de predisposición al cáncer de colon en una línea celular editada genéticamente mediante CRISPR/Cas9

Autor/a

Maestro Moral, Claudia

Abstract

El càncer colorectal (CCR) és el tercer tipus de càncer més diagnosticat en homes i el segon més diagnosticat en dones. Un factor important en la predisposició al càncer colorectal és l'herència genètica. El CCR hereditari inclou diverses síndromes classificades segons les seves característiques fenotípiques (síndromes polipósics i no polipósics) i gens causals. Després de seqüenciar els exomes de tres membres d’una família amb poliposi mixta, diverses variants van ser seleccionades segons de la seva presència en tots els membres de la família afectats de poliposi, la seva freqüència en controls poblacionals, la seva funció i el seu enriquiment en casos comparats amb controls. A partir d'aquests criteris, es va seleccionar PARP1 c.412C>T; p.Arg138Cys com a possible causa de l’elevat risc de desenvolupar poliposi en la família estudiada. Es van identificar quatre variants addicionals predites patogèniques en PARP1 en altres cohorts de pacients amb poliposi. L'objectiu d'aquest estudi és generar models cel·lulars per provar l'impacte funcional de les variants PARP1 identificades. L'eina d'edició genètica CRISPR-Cas9 es va utilitzar per generar una línia cel·lular heterozigota PARP1 knock-out (KO) i posteriorment una línia de cèl·lules KO homozigota. La correcta edició gènica es va verificar seqüenciant els clons de cada línia cel·lular, seguit d'una anàlisi d'expressió mitjançant RT-PCR quantitativa i semi-quantitativa i Western Blot (WB). Els models knock-in que inclouen les variants en estudi en les cèl·lules KO heterozigotes s'estan generant actualment. La selecció dels clons editats es realitzarà amb les proves de genotipatge KASP que hem dissenyat.

 

Director/a

Semino Margrett, Carlos
Valle, Laura

Estudis

IQS SE - Grau en Biotecnologia

Data

2021-06-17